Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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