Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zc2hc1bQ9D534 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms