Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc130Q9D516 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms