Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms