Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gcc1Q9D4H2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gcc1Q9D4H2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gcc1Q9D4H2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms