Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms