Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iqcf3Q9D498 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms