Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933425L06RikQ9D3Z8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms