Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms