Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4933436I01RikQ9D3T1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms