Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rufy3Q9D394 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rufy3Q9D394 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms