Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms