Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fndc8Q9D2H8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms