Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms