Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ss18l2Q9D174 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms