Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift27Q9D0P8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ift27Q9D0P8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift27Q9D0P8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ift27Q9D0P8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift27Q9D0P8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ift27Q9D0P8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift27Q9D0P8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift27Q9D0P8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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