Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyc1Q9D0M3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyc1Q9D0M3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms