Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Zbed3Q9D0L1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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