Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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