Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp11Q9CZJ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms