Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms