Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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