Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bud23Q9CY21 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bud23Q9CY21 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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