Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms