Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmed5Q9CXE7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms