Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sugt1Q9CX34 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sugt1Q9CX34 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms