Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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