Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkrip1Q9CWV6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms