Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms