Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud1Q9CUB6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms