Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sft2d3Q9CSV6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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