Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rprd1bQ9CSU0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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