Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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