Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms