Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmd9Q9CR00 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmd9Q9CR00 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms