Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Mrpl20Q9CQL4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mrpl20Q9CQL4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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