Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrpb2Q9CQI7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms