Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms