Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms