Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc5Q9CQA1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc5Q9CQA1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms