Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pkp2Q9CQ73 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pkp2Q9CQ73 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms