Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpa3Q9CQ71 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpa3Q9CQ71 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms