Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
1700029P11RikQ9CQ68 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms