Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NenfQ9CQ45 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NenfQ9CQ45 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms