Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms