Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms