Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup155Q99P88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nup155Q99P88 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms