Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atoh8Q99NA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms