Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brms1Q99N20 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brms1Q99N20 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms