Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms